#生技醫藥新訊
【基因剪輯阻斷病毒在細胞內傳播 COVID-19有機會發展新療法】
根據13日公布的研究報告,科學家使用CRISPR基因剪輯技術,成功在實驗室阻斷SARS-CoV-2病毒在已感染人類細胞內傳播,讓2019冠狀病毒疾病(COVID-19)有機會出現新的治療方法。
一群澳洲研究人員在「自然通訊」(Nature Communications)期刊上寫道,這種基因工具能在實驗室中有效防止病毒傳播,他們希望很快就能展開動物實驗。
CRISPR讓科學家能夠修改DNA序列和基因功能,之前就已嶄露頭角,可望用於消除促使兒癌病程發展的基因編碼。
團隊在最新研究中使用名叫CRISPR-Cas13b的酶,它能與新型冠狀病毒的相關RNA序列結合,降解病毒在人類細胞內複製所需的基因組。
來自澳洲「彼得多哈堤感染與免疫研究所」(Peter Doherty Institute for Infection and Immunity)的第一作者呂因(Sharon Lewin)告訴法新社,團隊已設計出能辨識SARS-CoV-2病毒的CRISPR工具。COVID-19就是這種病毒所引發。
呂因說:「一旦病毒被辨識出來,這種CRIPSR酶就會啟動,把病毒大卸八塊。」
「我們瞄準病毒數個部位,包括非常穩定不變和變異性很高的部位,都能非常有效分解病毒。」
這種技術用於「高關注變異株」(VOC)樣本上,也能成功阻止病毒複製。所謂的高關注變異株包括最早在英國發現的Alpha變異株等。
雖然目前市場上已有數款COVID-19疫苗,但可用的治療選項仍相對稀少,而且僅部分有效。
呂因坦承要把CRISPR應用在容易取得的藥物上,可能還得等上「好幾年而非幾個月」。但她堅稱這種工具仍有可能臂助抗疫。
呂因說:「我們還需要為COVID-19住院病患找出更好的治療方法。我們現有的選項有限,最多只能減少3成死亡風險。」
文章來源:https://www.cna.com.tw/news/firstnews/202107130357.aspx
#基因剪輯 #CRISPR
同時也有2部Youtube影片,追蹤數超過5,140的網紅寶博士,也在其Youtube影片中提到,【來賓:謝伯讓博士 腦科學家】錄音時間2020.07.23 🔆謝伯讓的腦科學世界 https://www.facebook.com/pojanghsieh/ 📍 Neuralink https://zh.wikipedia.org/wiki/Neuralink 📍 8/28!馬斯克公布腦機介面公司 ...
「crispr應用」的推薦目錄:
crispr應用 在 尤稚凱醫師 Facebook 的精選貼文
轉貼林品均博士的文章:
重點在於投藥治療似乎很有希望!人類真是厲害。
"看了一下 武漢病毒 2019-nCoV (novel Coronavirus) 的幾篇研究研究與新聞,我這邊筆記一下
沒特別編輯,也不夠科普🤣🤣,如果有人看了發現有錯或更新 再提醒我一下🙏
‼️Therapy
目前還沒有任何核發的新病毒藥物,不過好像有幾個好消息 (?) 昨天發表在醫學權威期刊 NEJM 的病例報告 [1],也就是兩週前在美國華盛頓州第一例確診武漢病毒的中國人,他一開始只有發燒症狀,但住院第5天 (發病第9天) 突然出現肺部異音、肺炎跡象並且惡化很快! 再加上呼吸急促、血氧驟降 (因肺出狀況) 需供氧治療,這並非典型肺炎處理方法可解決的,醫院只好給予治療 Ebola Virus Disease 的、開發中的 💊remdesivir 試看看...XD
Remdesivir 是個 nucleotide analogue,機制是讓複製酵素 (RdRp) 複製病毒 RNA 時做不下去,原先是開發給 Ebola Virus Disease用的,但 2018在非洲剛果的 673人臨床試驗發現大失敗 [2],死亡率高於較早開發的另外也在開發的兩隻 monoclonal antibody drugs: MAb114 & REGN-EB3 (bind 病毒上的 glycoprotein 以防止其跟宿主 receptor反應而減少感染 [2]) 。阿因為冠狀病毒也有 RdRp 所以他們就試試看,在2019年底發表了:施用 remdesivir 於 感染 SARS-CoV、MERS-CoV 的小鼠,體內病毒大幅減少 [3]!!!開啟了將這隻藥拿來治療華盛頓州那位病人的試驗。 ps. 沒有拿到新藥試驗許可 或 NDA 就可以開始做臨床跟施藥,也就是所謂「同情用藥」(compassionate use)。)
結果用藥的隔天,他發燒跟肺炎的狀況就好許多[1]!!!開發 remdesivir 的製藥公司 Gilead 應該爽死了。不過...後續的臨床試驗才是考驗.. Gilead 已開始跟中國確診病患們合作,希望都跟第一例試驗一樣順利 (?)
至於中國方面則是使用藥物蛋白質 binding預測,大規模搜尋,找出一些最有機會成為抗 2019-nCoV 的已在市面上的藥 [4],其中前幾名,💊lopinavir & ritonavir (為 艾伯維 AbbVie 的抗愛滋病毒藥,商品名 Kaletra) (作用是 bind 並抑制 HIV的 protease,使病毒的 polyprotein 無法被切割成為 有功能的 proteins而被抑制) 。且 lopinavir & ritonavir 在當年 SARS爆發時曾被拿出來研究是否可以 in vitro 抑制之,結果可以 [5]。接著中國41位SARS病患施給此藥物後,體內病毒量降低、免疫系統也較控制組活化 [5]!而武漢病毒也是有蛋白需要被 protease 切開,因此也在 off label use情況下,約五天前在武漢直接用在病人身上,目前還沒有發表結果,不過感覺很有希望哦。
‼️Virus origin
可能因為上面愛滋病毒藥的事件,導致一堆人又說起中國改造病毒當生化武器。昨晚一篇線上發表 [6] 更把風向帶到這個陰謀論,害我還花時間去研究.... 這篇尚未 peer reviewd 的線上論文,是印度人做的。 2019-nCoV 既稱為新型冠狀病毒,他跟其他 family members 差異最大的地方就是 genome 中間的 spike protein區 [7],印度團隊宣稱他們把這段拿去資料庫 BLAST,得到愛滋病毒 HIV 的序列 hit (且是結合免疫細胞的重要蛋白),宣稱找到武漢病毒 4個 insertions,是其他冠狀病毒沒有 而HIV有的。這篇研究直接導出結論是,不太可能是自然發生而是人為??!.....陰謀論加上扯到愛滋,大家都嚇壞了
不過我實際去將整段,或是他宣稱的短的 motif 去做 BLAST.. 根本找不到 HIV 序列.. 還有在很多細菌或其他生物都能找到一樣的序列...且根本太短 四片段都是 6-8個氨基酸而已。 所以那篇方法應有問題、結論根本粗糙,愛滋病毒跟武漢病毒的連結就只有都會使用到 viral protease而已。然後他們究竟怎麼 BLAST到 HIV的呀?
‼️Diagnosis
目前要診斷 2019-nCoV 的方法只有使用 RT-PCR檢測,必須採樣後送至實驗室,耗時 5-6小時,如果加上排隊或運送(或有時湊不滿一次上機一盒試劑的量而要等待),就可能 24小時以上才知有無感染。所以大家都在開發更即時的方法。昨天 UCSF 與 Mammoth Biosciences (就是 CRISPR應用發明者之一 Jennifer Doudna開的,用 CRISPR核酸配對來偵測病毒 的公司) 宣稱他們已開發用 CRISPR技術 在兩小時內檢測出武漢病毒 [8]!並且是 point-of-care 也就是用試紙或其他方式,在採樣地點(診間、機場、救護車等)就可以測完+看結果。當然其他大小公司也拼命發新聞稿,不論是開發疫苗、療法或是檢測方法,非常多的研究,希望可以遏止住疫情以及強化科研發展....
-\-\
ref
[1] First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States. NEJM. Jan 31, 2020.
[2] A Randomized, Controlled Trial of Ebola Virus Disease Therapeutics. NEJM. Dec 12, 2019.
[3] Coronavirus Susceptibility to the Antiviral Remdesivir (GS-5734) Is Mediated by the Viral Polymerase and the Proofreading Exoribonuclease. mBio. Mar 6. 2018
[4] https://innophore.com/2019-ncov/
[5] Role of lopinavir/ritonavir in the treatment of SARS: initial virological and clinical findings. Thorax. 2004; 59: 252-256
[6] https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.26.920249v1
[7] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. THE LANCET. Jan 30, 2020
[8] https://www.sfchronicle.com/…/Coronavirus-UCSF-expert-worki…
(最新幾篇研究可能未經同儕審查,應持保留態度)"
crispr應用 在 尤稚凱醫師 Facebook 的精選貼文
轉貼林品均博士的文章:
重點在於投藥治療似乎很有希望!人類真是厲害。
"看了一下 武漢病毒 2019-nCoV (novel Coronavirus) 的幾篇研究研究與新聞,我這邊筆記一下
沒特別編輯,也不夠科普🤣🤣,如果有人看了發現有錯或更新 再提醒我一下🙏
‼️Therapy
目前還沒有任何核發的新病毒藥物,不過好像有幾個好消息 (?) 昨天發表在醫學權威期刊 NEJM 的病例報告 [1],也就是兩週前在美國華盛頓州第一例確診武漢病毒的中國人,他一開始只有發燒症狀,但住院第5天 (發病第9天) 突然出現肺部異音、肺炎跡象並且惡化很快! 再加上呼吸急促、血氧驟降 (因肺出狀況) 需供氧治療,這並非典型肺炎處理方法可解決的,醫院只好給予治療 Ebola Virus Disease 的、開發中的 💊remdesivir 試看看...XD
Remdesivir 是個 nucleotide analogue,機制是讓複製酵素 (RdRp) 複製病毒 RNA 時做不下去,原先是開發給 Ebola Virus Disease用的,但 2018在非洲剛果的 673人臨床試驗發現大失敗 [2],死亡率高於較早開發的另外也在開發的兩隻 monoclonal antibody drugs: MAb114 & REGN-EB3 (bind 病毒上的 glycoprotein 以防止其跟宿主 receptor反應而減少感染 [2]) 。阿因為冠狀病毒也有 RdRp 所以他們就試試看,在2019年底發表了:施用 remdesivir 於 感染 SARS-CoV、MERS-CoV 的小鼠,體內病毒大幅減少 [3]!!!開啟了將這隻藥拿來治療華盛頓州那位病人的試驗。 ps. 沒有拿到新藥試驗許可 或 NDA 就可以開始做臨床跟施藥,也就是所謂「同情用藥」(compassionate use)。)
結果用藥的隔天,他發燒跟肺炎的狀況就好許多[1]!!!開發 remdesivir 的製藥公司 Gilead 應該爽死了。不過...後續的臨床試驗才是考驗.. Gilead 已開始跟中國確診病患們合作,希望都跟第一例試驗一樣順利 (?)
至於中國方面則是使用藥物蛋白質 binding預測,大規模搜尋,找出一些最有機會成為抗 2019-nCoV 的已在市面上的藥 [4],其中前幾名,💊lopinavir & ritonavir (為 艾伯維 AbbVie 的抗愛滋病毒藥,商品名 Kaletra) (作用是 bind 並抑制 HIV的 protease,使病毒的 polyprotein 無法被切割成為 有功能的 proteins而被抑制) 。且 lopinavir & ritonavir 在當年 SARS爆發時曾被拿出來研究是否可以 in vitro 抑制之,結果可以 [5]。接著中國41位SARS病患施給此藥物後,體內病毒量降低、免疫系統也較控制組活化 [5]!而武漢病毒也是有蛋白需要被 protease 切開,因此也在 off label use情況下,約五天前在武漢直接用在病人身上,目前還沒有發表結果,不過感覺很有希望哦。
‼️Virus origin
可能因為上面愛滋病毒藥的事件,導致一堆人又說起中國改造病毒當生化武器。昨晚一篇線上發表 [6] 更把風向帶到這個陰謀論,害我還花時間去研究.... 這篇尚未 peer reviewd 的線上論文,是印度人做的。 2019-nCoV 既稱為新型冠狀病毒,他跟其他 family members 差異最大的地方就是 genome 中間的 spike protein區 [7],印度團隊宣稱他們把這段拿去資料庫 BLAST,得到愛滋病毒 HIV 的序列 hit (且是結合免疫細胞的重要蛋白),宣稱找到武漢病毒 4個 insertions,是其他冠狀病毒沒有 而HIV有的。這篇研究直接導出結論是,不太可能是自然發生而是人為??!.....陰謀論加上扯到愛滋,大家都嚇壞了
不過我實際去將整段,或是他宣稱的短的 motif 去做 BLAST.. 根本找不到 HIV 序列.. 還有在很多細菌或其他生物都能找到一樣的序列...且根本太短 四片段都是 6-8個氨基酸而已。 所以那篇方法應有問題、結論根本粗糙,愛滋病毒跟武漢病毒的連結就只有都會使用到 viral protease而已。然後他們究竟怎麼 BLAST到 HIV的呀?
‼️Diagnosis
目前要診斷 2019-nCoV 的方法只有使用 RT-PCR檢測,必須採樣後送至實驗室,耗時 5-6小時,如果加上排隊或運送(或有時湊不滿一次上機一盒試劑的量而要等待),就可能 24小時以上才知有無感染。所以大家都在開發更即時的方法。昨天 UCSF 與 Mammoth Biosciences (就是 CRISPR應用發明者之一 Jennifer Doudna開的,用 CRISPR核酸配對來偵測病毒 的公司) 宣稱他們已開發用 CRISPR技術 在兩小時內檢測出武漢病毒 [8]!並且是 point-of-care 也就是用試紙或其他方式,在採樣地點(診間、機場、救護車等)就可以測完+看結果。當然其他大小公司也拼命發新聞稿,不論是開發疫苗、療法或是檢測方法,非常多的研究,希望可以遏止住疫情以及強化科研發展....
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ref
[1] First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States. NEJM. Jan 31, 2020.
[2] A Randomized, Controlled Trial of Ebola Virus Disease Therapeutics. NEJM. Dec 12, 2019.
[3] Coronavirus Susceptibility to the Antiviral Remdesivir (GS-5734) Is Mediated by the Viral Polymerase and the Proofreading Exoribonuclease. mBio. Mar 6. 2018
[4] https://innophore.com/2019-ncov/
[5] Role of lopinavir/ritonavir in the treatment of SARS: initial virological and clinical findings. Thorax. 2004; 59: 252-256
[6] https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.26.920249v1
[7] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. THE LANCET. Jan 30, 2020
[8] https://www.sfchronicle.com/…/Coronavirus-UCSF-expert-worki…
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📍Adrian Owen 神經科學家 - 植物人患者研究 https://en.wikipedia.org/wiki/Adrian_Owen
📍電影《Sixty Million Dollar Man (百變星君/百變金剛)》 https://en.wikipedia.org/wiki/Sixty_Million_Dollar_Man
📍《大腦簡史:生物經過四十億年的演化,大腦是否已經超脫自私基因的掌控?》作者:謝伯讓 https://www.books.com.tw/products/0010723238
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主持:北科大互動設計系 專任助理教授 葛如鈞/寶博士
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crispr應用 在 Cup 媒體 Cup Media Youtube 的最佳解答
「CRISPR」靈感取自細菌的抗病毒機制:當細菌碰上病毒 DNA,便會製造出與病毒基因相應的 RNA,並與蛋白質(Cas9)粘合,繼而分工:RNA 負責導航找尋相應病毒,蛋白質負責切除病毒基因鏈,從而消滅病毒。CRISPR 比細菌則更進一步:剪裁之後補貼健康基因。
雖說 CRISPR 並非「發明」,而是「發現」出來,但該項應用技術無疑劃時代創新,甚至超前科學。人類約有二萬至二萬五千組基因,「人類基因百科全書計劃」(ENCODE)現已辨識八成基因行為,其餘存疑。通過 CRISPR「微調」基因,便能得悉特定基因的表現及行為。向來科學造就科技,現在由科技推進科學,不僅是基因解碼工程的突破,更標誌科學界的巨變。
另一重大意義在於醫療突破。除了從根本改變醫療方向外,CRISPR「Cut and Paste」操作簡易,成本低廉,有助普及治療。哈佛基因學家 George Church 表示,成立一間 CRISPR 實驗室只需二千美元,而實驗成本甚至低至一百美元。
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